在水产养殖过程中，益生菌常作为生长促进剂、免疫促进剂、治疗剂、水质改良剂进行实际应用，根据菌种不同来区分，常用的益生菌有光合细菌、芽孢杆菌、乳酸菌、酵母菌、蛭弧菌、硝化细菌等。

①许多微生态制剂本身就含有大量的营养物质，有促进植物生长的功能。

②一些微生物在其发酵或代谢过程中，产生一定量的植物内源生长调节剂能使作物生长健壮，促熟增产，具有抗衰老、抗干旱、抗盐碱、抗强光、抗干热风等作用。

③一些微生物可产生药理活性物质，直接调节微生物区系，抑制病原菌，控制病害发生，达到预防和治疗作用。

④微生态制剂的微生物均为有益菌，它们与植物体内有益菌一起形成强有力的优势种群，大量繁殖，通过竞争抑制使有害菌的增殖受到抑制。

属于厌氧或兼性厌氧性的光能异养菌。在光照条件下，光合细菌能利用小分子有机物合成自身生长繁殖所需要的各种养分，增加水体溶氧，还能利用水环境中的氨氮、硝酸盐、亚硝酸盐等合成有机氮化物，净化水质；在缺氧条件下，光合细菌对硫化氢、酸性物质等均有一定的分解作用。此外，光合细菌可以产生抗病毒因子等生物活性物质，具有独特的抗病、微生态制剂促生长功能，大大提高了水产动物的生产性能的优点。

1、分泌作用：通过分泌细菌素、胞外酶等物质，抑制或杀灭有害细菌；

2、竞争作用：通过分泌抑制性物质，竞争营养物质，竞争宿主的定植位点或通过竞争排斥的原理，抑制有害细菌的生长繁殖；

3、提高水产动物的免疫力：通过提高抗体水平和巨噬细胞的活动，激活机体体液和细胞免疫系统从而提升宿主的免疫能力；

4、净化改良水环境：通过直接或间接的分解和利用养殖水体中的有机物质，减少氨氮、亚硝酸盐的含量，抑制有害细菌滋生，改善水体环境，促进水产动物的健康生长；